Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms