Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms