Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx29Q9D3S3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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