Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy3Q9D394 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms