Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Snrnp35Q9D384 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snrnp35Q9D384 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snrnp35Q9D384 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snrnp35Q9D384 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms