Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt20Q9D312 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms