Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms