Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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