Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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