Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms