Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms