Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snf8Q9CZ28 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snf8Q9CZ28 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snf8Q9CZ28 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snf8Q9CZ28 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snf8Q9CZ28 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snf8Q9CZ28 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snf8Q9CZ28 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms