Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms