Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RpainQ9CWY9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RpainQ9CWY9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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