Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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