Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms