Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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