Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed6Q9CQG0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms