Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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