Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms