Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms