Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim3Q99PE5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms