Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NsmfQ99NF2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms