Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms