Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hdac9Q99N13 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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