Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms