Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms