Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms