Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms