Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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