Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms