Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms