Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms