Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd3Q91WC0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd3Q91WC0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd3Q91WC0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms