Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms