Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms