Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms