Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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