Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ttc8Q8VD72 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ttc8Q8VD72 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ttc8Q8VD72 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc8Q8VD72 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms