Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms