Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hecw1Q8K4P8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms