Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms