Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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