Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms