Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c1Q8K284 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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