Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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LgsnQ8CIX8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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LgsnQ8CIX8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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LgsnQ8CIX8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms