Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms