Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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