Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms