Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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